Universitas Pekalongan- Fakultas Perikanan Unikal menjalin kerjasama dengan Balai Perikanan Budidaya Air Payau (BPBAP) Situbondo. Kerjasama tersebut tertuang dalam sebuah MoU dan MoA. Penandatanganan MoU oleh Rektor Unikal Andi Kushermanto, S.E., M.M. dilaksanakan secara desk to desk bertempat di BPBAP Situbondo, Jawa Timur. Tujuan utama dari MoU yaitu untuk menjalin kerjasama dalam bidang penelitian, pengabdian, dan pendidikan. Selain dilaksanakan penandatanganan MoU secara desk to desk, dilaksanakan pula penandatanganan MoA oleh Dr. Pi. Ir. M. Bahrus Syakirin, M.Si. selaku dekan Fakultas Perikanan secara desk to desk yang diwakilkan oleh tim PPdK dan dosen Fakultas Perikanan Universitas Pekalongan. Kemudian penandatanganan MoU dan MoA oleh BPBAP Situbondo oleh Boyun Handoyo, S.Pi., M.Si selaku Kepala BPBAP Situbondo.
Balai Perikanan Budidaya Air Payau Situbondo merupakan Unit Pelaksana Teknis (UPT) di bawah Direktorat Jenderal Perikanan Budidadaya sesuai Peraturan Menteri Kelautan No.67 tahun 2020 tentang Organisasi dan Tata Kerja Unit Pelaksana Teknis Perikanan Budidaya. Balai Perikanan Budidaya Air Payau Situbondo telah berpengalaman melakukan berbagai kegiatan strategis dalam rangka mendukung pengembangan budidaya air payau sejak tahun 1995. Kegiatan rekayasa teknologi, kegiatan bimbingan dan pendampingan teknologi ke masyarakat pembudidaya, produksi induk dan benih udang/ikan, produksi pakan alami, produksi pakan buatan, kultur jaringan rumput laut, penyebaran informasi dan publikasi, pengawasan pembudidayaan ikan, pemantauan kesehatan ikan dan lingkungan, pelayanan pengujian laboratorium, dan uji kompetensi sumber daya manusia.
Harapan dari adanya MoU dan MoA ini, terlaksananya implementasi salah satunya yang akan dilaksanakan yaitu magang untuk mahasiswa, selain itu kerjasama dalam bidang penelitian dan pendidikan sebagai dosen praktisi atau dosen tamu.